Martinus W. Beijerinck, au complet Martinus Willem Beijerinck, (né le 16 mars 1851 à Amsterdam, Pays-Bas—décédé le 1er janvier 1931 à Gorssel), microbiologiste et botaniste néerlandais qui a fondé la discipline de virologie avec sa découverte des virus. Beijerinck a été le premier à reconnaître que les virus reproduisent des entités différentes des autres organismes. Il a également découvert de nouveaux types de bactéries du sol et décrit la fixation biologique de l’azote (la conversion de l’azote gazeux en ammonium, une forme utilisable par les plantes). Beijerinck a embrassé la dispute et a parfois montré peu de respect pour le travail des autres, refusant à une occasion une visite au laboratoire d’un bactériologiste allemand Robert Koch, pensant qu’il avait peu à apprendre de Koch. Peut-être pour ces raisons, ainsi que son dégoût pour la bactériologie médicale et sa concentration sur les micro-organismes du sol et des plantes, son travail n’a pas été aussi largement célébré que celui de Koch et du chimiste et microbiologiste français Louis Pasteur.
La famille de Beijerinck était extrêmement pauvre et il a reçu sa première éducation à la maison de son père. Il a commencé à fréquenter l’école à 12 ans et, même s’il se sentait inférieur et manquait de confiance en lui, il a ensuite atteint le sommet de sa classe grâce à son travail acharné et à sa capacité d’apprendre et de comprendre. C’est durant cette période qu’il développe un profond intérêt pour les plantes. Beijerinck a ensuite étudié à l’école polytechnique de Delft, où il a été admis grâce au soutien d’un oncle. La chimie est devenue son principal sujet d’étude, et il a effectué un certain nombre d’expériences avecJacobus Henricus van ‘t Hoff, qui devint plus tard le conseiller de Beijerinck (et qui en 1901 fut le premier lauréat du prix Nobel de chimie). En 1872, après avoir obtenu son diplôme de Delft, Beijerinck est devenu étudiant à l’Université de Leiden. Après avoir réussi son examen de candidature magna cum laude en 1873, il a occupé divers postes d’enseignant. Il obtient son doctorat à l’Université de Leiden en 1877.
Les méthodes d’enseignement de Beijerinck n’étaient pas appréciées par la plupart de ses étudiants et la recherche a toujours été son principal intérêt. En 1885, il quitta la vie universitaire pour devenir microbiologiste à la manufacture néerlandaise de levure et d’alcool à Delft, où il put consacrer tout son temps à la recherche. Même si le travail était exceptionnellement bien rémunéré, Beijerinck a rapidement regretté de l’avoir accepté, en partie parce qu’il le plaçait à Delft, alors une ville industrielle en déclin et éloignée de sa famille, et en partie parce qu’il ne s’entendait pas bien avec ses collègues. Il était sujet à des épisodes de dépression et en proie à un sentiment de morosité. Bien que son estime de soi soit restée faible, sa réputation scientifique a continué de s’étendre et, en 1895, le gouvernement néerlandais a créé un poste spécial pour lui à l’école polytechnique de Delft. Il y restera jusqu’à sa retraite en 1921.
Au début de sa carrière, Beijerinck a étudié les galles végétales, des gonflements des tissus végétaux maintenant connus pour être causés par l’invasion de divers agents infectieux. Ses recherches se sont de plus en plus concentrées sur la fermentation, un processus provoqué par la croissance de levures et d’autres micro-organismes dans un environnement anaérobie (un manque d’air). 
En 1888, il isole la bactérie Bacillus radicicola (plus tard classée comme un type de Rhizobium), qui vit dans les nodules racinaires des plantes légumineuses. Plus tard, il a fait d’autres avancées importantes dans la science des plantes et des sols grâce à ses études sur Azotobacter (un groupe de micro-organismes du sol), des bactéries dénitrifiantes (qui convertissent les nitrates du sol en azote atmosphérique libre), la fixation de l’azote et le virus de la mosaïque du tabac. Il a utilisé le terme virus filtrable pour décrire la capacité de ce dernier agent à passer à travers un filtre à pores fins. Il a décrit le virus comme un contagium vivum fluidum, pensant qu’il s’agissait d’un fluide plutôt que d’une entité particulaire. Beijerinck a également développé les principes de la culture d’enrichissement, qui ont permis de mieux comprendre le rôle des micro-organismes dans les processus naturels. Il a reçu une reconnaissance internationale pour cette découverte.
Beijerinck a également découvert la fixation de l’azote, le processus par lequel l’azote diatomique est converti en ammonium et devient disponible pour les plantes. Les bactéries effectuent la fixation de l’azote, s’installant à l’intérieur des nodules racinaires de certaines plantes (légumineuses). En plus d’avoir découvert une réaction biochimique vitale pour la fertilité des sols et l’agriculture, Beijerinck a révélé cet exemple archétypique de symbiose entre plantes et bactéries. Beijerinck a découvert le phénomène de réduction bactérienne des sulfates, une forme de respiration anaérobie. Il a appris que les bactéries pouvaient utiliser le sulfate comme accepteur d’électrons, au lieu de l’oxygène. Cette découverte a eu un impact important sur notre compréhension actuelle des cycles biogéochimiques. Spirillum desulfuricans a été la première bactérie sulfato-réductrice connue, isolée et décrite par Beijerinck. Beijerinck a inventé la culture d’enrichissement, une méthode fondamentale d’étude des microbes de l’environnement.
Beijerinck était une figure socialement maladroite. Il était verbalement violent envers les étudiants, ne s’est jamais marié et avait peu de collaborations professionnelles. Il était également connu pour son style de vie ascétique et sa vision de la science et du mariage incompatibles. Sa faible popularité auprès de ses étudiants le déprimait périodiquement, car il aimait beaucoup répandre son enthousiasme pour la biologie dans la classe.
Beijerinck a reçu la médaille Leeuwenhoek de l’Académie royale néerlandaise des sciences en 1905.
Virologie en biologie
Virologie, branche de la microbiologie qui s’occupe de l’étude des virus. Bien que les maladies causées par des virus soient connues depuis les années 1700 et que beaucoup aient été guéries (un peu plus tard), l’agent causal n’a été examiné de près qu’en 1892, lorsqu’un bactériologiste russe, D. Ivanovski, a observé que l’agent causal (s’est avéré plus tard être un virus) de la maladie de la mosaïque du tabac pourrait passer à travers un filtre en porcelaine imperméable aux bactéries. La virologie moderne a commencé lorsque deux bactériologistes, Frederick William Twort en 1915 et Félix d’Hérelle en 1917, ont découvert indépendamment l’existence de bactériophages (virus qui infectent les bactéries).:quality(75)/cloudfront-us-east-1.images.arcpublishing.com/elcomercio/NDTKPEQU4FEB3NLZYBFCGGUEVI.jpg)
La visualisation directe des virus est devenue possible après l’introduction du microscope électronique vers 1940. En 1935, le virus de la mosaïque du tabac est devenu le premier virus à se cristalliser ; en 1955, le virus de la poliomyélite s’est cristallisé. (Un « cristal » viral se compose de plusieurs milliers de virus et, en raison de sa pureté, se prête bien aux études chimiques.) La virologie est une discipline d’intérêt immédiat car de nombreuses maladies humaines, dont la variole, la grippe, le rhume et le sida, ainsi qu’une foule de maladies végétales et animales économiquement importantes, sont causées par des virus.
Virologie – Généralités sur les virus
Introduction
Tous les organismes vivants sont potentiellement sensibles à un ou plusieurs virus. Des estimations réalisées sur différents prélèvements indiquent que les virus sont les “micro-organismes” les plus abondants sur terre, avec par exemple 10 millions de particules virales dans 1 ml d’eau de mer. Si les virus font peur par leur aspect d’entité biologique causant des maladies, leur étude a permis de réaliser de nombreuses découvertes en biologie. ils s’avèrent aussi très utiles et utilisés dans des protocoles de thérapie génique.
Qu’est-ce qu’un virus ?
Le mot virus est d’origine latine et signifie littéralement poison ou venin. Ce terme n’a été employé pour la première fois que vers la fin du XIXème pour désigner sans distinction tous les micro-organismes infectieux, puis utilisé spécifiquement pour ces agents qui nous entourent sans que nous puissions les voir.
Les virus sont des parasites intracellulaires obligatoires parce qu’ils dépendent intégralement de la cellule pour se multiplier. Leur multiplication affecte d’une manière plus ou moins forte les systèmes qu’ils parasitent. Les virus sont caractérisés par leur petite taille, de 17 à 300 nm, exception faite des virus géants (500 nm-1,5 µm) découverts récemment. Par conséquent, leur observation nécessite un microscope électronique.
Le matériel génétique recèle toute l’information nécessaire à générer un nouveau virus complet, semblable à l’original. Les protéines (la capside – manteau du virus) protègent le matériel génétique. 
La capside peut elle-même être entourée d’une enveloppe chez certains virus (photos). Ces structures (la capside ou l’enveloppe) permettent au virus de reconnaître une cellule hôte (sans se tromper), d’y pénétrer ou d’y introduire son matériel génétique, pour induire sa multiplication et sortir en de multiples copies pour en infecter d’autres. Cette sortie s’accompagne ou pas immédiatement de la destruction de la cellule. Ainsi, le cycle de multiplication viral comprend tous les événements qui conduisent à la formation de nouvelles particules virales infectieuses : l’attachement et l’entrée du virus et la décapsidation du génome (ou l’injection directe du génome) dans la cellule hôte, l’expression et la réplication du génome viral, la formation des nouveaux virions et finalement, la libération des nouveaux virus.
Les virus présentent une extraordinaire diversité de forme, de structure, de taille, de modes d’expression et de réplication qui permet aux scientifiques de définir des critères pour les classer dans le but de comprendre leur histoire évolutive. Ils sont ainsi regroupé en « royaume » (ex. Riboviria), « ordre » (ex. Nidovirales), « famille » (ex. Coronaviridae), « sous-famille » (ex. Coronavirinae) genre (ex. Alpha coronavirus) et espèce (ex. Human coronavirus 229E).
Qu’est-ce qu’une émergence virale ? 
L’émergence repose sur l’introduction, chez une population vulnérable, d’un nouveau facteur infectieux (par ex. évolution d’un virus circulant chez l’homme, passage d’un virus d’une espèce animale à l’homme).
Virologie
Vaincre les infections virales qui affectent la santé humaine. C’est le combat du département de Virologie. Pour cela, ses équipes de recherche étudient comment les virus infectent leurs hôtes, causent les maladies et comment ils se propagent. La connaissance approfondie de la biologie des virus et des mécanismes de défense qu’ils déclenchent chez leur hôte leur permettent de proposer et mettre au point des stratégies (vaccins, antiviraux…) pour combattre les maladies ou s’en protéger.
D’immenses progrès ont été réalisés dans la lutte contre les maladies virales et les combats qui restent à mener en virologie revêtent une importante dimension de santé publique en particulier avec l’émergence des maladies virales transmises par les moustiques (arboviroses) comme la dengue, Zika ou Chikungunya. La variole a ainsi pu être éradiquée dans les années 70 par une campagne de vaccination de l’Organisation mondiale de la santé (OMS). Un programme mondial vise aujourd’hui à éradiquer la poliomyélite. L’institut Pasteur y participe en tant que Centre collaborateur de l’OMS sur les entérovirus et les vaccins viraux. Le département de Virologie compte plusieurs Centres nationaux de référence (CNR) et Centres internationaux collaborateurs de l’OMS (CCOMS) dont les activités permettent à l’Institut Pasteur de contribuer au diagnostic, à la surveillance et à la caractérisation des émergences.
Une intense activité de recherche
Les 17 unités de recherche que compte le département de Virologie ont comme objectifs de comprendre comment les virus pénètrent et se multiplient dans les cellules ; comment ils interagissent avec les mécanismes de défense de l’hôte qu’ils infectent (l’homme) ; quelles sont les bases moléculaires de leur virulence ou de leur perte de virulence (atténuation) ; quels sont les événements qui permettent aux virus animaux de franchir les barrières d’espèce et se propager dans les populations humaines. Les laboratoires suivent la propagation des infections, l’extension des territoires colonisés par les insectes vecteurs et tentent de prédire l’émergence de nouvelles épidémies pour les populations humaines. Les chercheurs identifient aussi les anticorps capables de neutraliser des souches virales et étudient le mécanisme d’action des anticorps neutralisants. Tout cela, bien sûr, pour mettre au point des vaccins, ou identifier des molécules antivirales…
Les recherches se concentrent ainsi sur de nombreux virus :
Les virus respiratoires comme celui de la grippe ou du SRAS ;
Les virus à l’origine de cancers comme le papillomavirus, HPV, le virus T lymphotropique humain (HTLV) ou les virus des hépatites B et C ;
Les rétrovirus tels que le virus de l’immunodéficience humain (VIH) ou simien (SIV) ;
Les virus infectant le système nerveux (virus de la rage, de la fièvre jaune, de la polio, entérovirus A71…) ;
les virus transmis par les insectes et responsables de maladies sévères (dengue, chikungunya, Zika, fièvre de la vallée du Rift) ;
Ou encore les virus responsables de fièvres hémorragiques (virus de la fièvre de Lassa, virus Ebola).
Des membres du département interviennent dans des cours de spécialisation en virologie dispensés par l’Institut, dans le réseau international des Instituts Pasteur (dispensés par Noël Tordo, Roberto Bruzzone, Anna-Bella Failloux…) et en ligne via une série de MOOCs (vaccinologie, immunité innée, entomologie médicale…).
Comment les virus de l’herpès se réactivent
Une fois que les virus de l’herpès ont infecté notre organisme, ils entrent souvent en phase de dormance, mais se réveillent parfois. Le mécanisme de ce réveil vient d’être mis au jour chez l’un d’eux.
Botanique en biologie
Botanique, branche de la biologie qui traite de l’étude des plantes, y compris leur structure, leurs propriétés et leurs processus biochimiques. Sont également inclus la classification des plantes et l’étude des maladies des plantes et des interactions avec l’environnement. Les principes et les découvertes de la botanique ont fourni la base de sciences appliquées telles que l’agriculture, l’horticulture et la foresterie. Les plantes étaient d’une importance primordiale pour les premiers humains, qui en dépendaient comme sources de nourriture, d’abri, de vêtements, de médicaments, d’ornements, d’outils et de magie. Aujourd’hui, on sait qu’en plus de leurs valeurs pratiques et économiques, les plantes vertes sont indispensables à toute vie sur Terre : grâce au processus de photosynthèse, les plantes transforment l’énergie du Soleil en énergie chimique des aliments, ce qui rend toute vie possible. Une deuxième capacité unique et importante des plantes vertes est la formation et la libération d’oxygène en tant que sous-produit de la photosynthèse. L’oxygène de l’atmosphère, absolument indispensable à de nombreuses formes de vie, représente l’accumulation de plus de 3 500 000 000 d’années de photosynthèse par les plantes vertes et les algues. Bien que les nombreuses étapes du processus de la photosynthèse n’aient été pleinement comprises que ces dernières années, même à l’époque préhistorique, les humains reconnaissaient intuitivement qu’il existait une relation importante entre le Soleil et les plantes. Une telle reconnaissance est suggérée par le fait que le culte du Soleil était souvent combiné avec le culte des plantes par les premières tribus et civilisations.
Au fil du temps, les plantes n’ont pas seulement été récoltées mais aussi cultivées par les humains. Cette domestication s’est traduite non seulement par le développement de l’agriculture mais aussi par une plus grande stabilité des populations humaines jusqu’alors nomades. De l’installation des peuples agricoles dans des lieux où ils pouvaient compter sur des approvisionnements alimentaires suffisants sont nés les premiers villages et les premières civilisations. En raison de la longue préoccupation des humains pour les plantes, un grand corpus de folklore, d’informations générales et de données scientifiques réelles se sont accumulé, qui est devenu la base de la science de la botanique.
Martinus Beijerinck (1851-1931)
Botaniste néerlandais qui a été l’un des premiers microbiologistes à reconnaître l’importance des bactéries lactiques pour la production alimentaire. Il a contribué à l’agriculture, la botanique, la microbiologie, la chimie et la génétique. Dans ses recherches sur les guêpes biliaires et la formation de galles (1882), il a jeté les bases de la théorie de l’ontogénie chez les plantes et les animaux supérieurs selon laquelle les enzymes de croissance agissent en série dans un ordre fixe (1917). Comme son père était un marchand de tabac qui a fait faillite, il a fait des recherches sur le virus de la mosaïque du tabac, qui provoque une maladie des plants de tabac avec de graves conséquences économiques. Il a découvert que même après avoir filtré la sève d’une plante infectée pour éliminer les bactéries, le liquide était toujours capable de transmettre l’infection à une autre plante. Ainsi, il savait que la maladie n’était pas due à des bactéries, mais à quelque chose d’autre dans le liquide, qu’il a appelé un virus filtrable (du mot latin pour poison) mais dont les chercheurs ultérieurs ont démontré qu’il avait en fait une forme particulaire.
https://www.bionity.com/en/encyclopedia/Martinus_Beijerinck.html
https://www.britannica.com/biography/Martinus-W-Beijerinck
https://www.pasteur.fr/fr/nos-missions/recherche/virologie
https://www.granger.com/results.asp?image=0107010
https://sfv-virologie.org/generalites-sur-les-virus